空氣潔凈技術在一些方面是依附于空調技術的。維持室內潔凈要求的系統是在空調系統的基礎上完善、充實而形成的。用于制藥、食品、醫療、化妝品等行業的生物潔凈室又是在用于電子、宇航、精密加工、冶金等行業的工業潔凈室的基礎上，采取了一些適應生物凈化特點，對藥廠而言還有防止交叉污染的措施。如前所述，藥廠的空調凈化措施是實施GMP法的重要環節之一。為此，需對空調、凈化系統的基本型式和行業特點有所了解。
空調系統的分類按空氣處理設備的設置情況，空調系統可分為：
1．集中系統，即所有空氣處理設備（風機、表冷器、加熱器、加濕器，過濾器等）集中設置在空調機房內的系統。被處理空氣通過送、回風管道輸配到各空調房間，并形成循環。這是目前多數藥廠采用的空調方式。
2．半集中系統，除設有集中機房外，還設有分散在各被調房間的冷熱交換裝置等二次設備，其功能是在空氣進入各空調房間前，對來自集中處理設備的空氣，根據各室的需要作進一步處理。如辦公樓、賓館等常用的風機盤管系統和國內不多見的誘導空調系統等。
3．全分散系統，采用落地柜機、懸掛箱機以至壁掛、窩式空調機組，靈活而分散地直接設置在空調房間或相鄰走廊等近處，供給房間所需冷、熱.